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“逐梦科研路,上下求索心”生物软件学习交流会

  2020年7月26日,为了让2019级硕士研究生及其他有生物软件学习需求的所内学生加深对生物软件功能的认知,掌握对生物软件的基本操作,以便尽快投入到科研工作中,我所学生会联合2019级学生班委在综合楼五楼报告厅举办了以“逐梦科研路,上下求索心”为主题的生物软件学习交流会,交流会由学生会主席王连顺主持。

  此次活动邀请了熟悉实用生物软件的在所学生口蹄疫防控技术与创新团队的王连顺同学、猪禽消化道感染与粘膜免疫团队的张昆同学、家畜寄生虫病创新团队王立群同学和外寄生虫与虫媒疫病创新团队的曹天行同学分别为大家分享了NCBI blast , primer 5.0 , DNASTAR. Lasergene.v7.1, SnapGene Viewer,MEGA6.0 ,image J等软件的使用。

  交流会上,张昆同学就英文文献获取(SCI-HUB),NCBI官网目的基因序列获取,RT-PCR引物设计,双酶切引物设计,NCBI blast序列比对等进行讲解。曹天行同学以primer 5.0引物设计为主题,用实例给同学们展示了如何在NCBI上获取的目的片段进行正反向引物设计,提取到合适的引物长度的大小,设计引物时遇到的发卡结构、上下游错配应该如何处理,引物GC含量最适范围,引物所对应的模版序列的Tm值以及双酶切引物设计时如何插入酶切位点,保护碱基。此外还讲述了利用MEGA6.0如何进行序列比对,制作遗传进化树等。

  随后,王连顺同学引用实例分享了SnapGene Viewer的使用方法,主要包括酶切位点查找,质粒图谱构建,模拟PCR做出目的片段等。学习交流会以王立群同学讲解的image J 软件对Western Blot条带进行灰度扫描结尾。主要讲授如何操作计算每一个泳道的灰度值,导出泳道数据后,检测靶标和内参actin对比,以及计算数据后用SPSS软件作图分析。

  此次学习交流会不仅让在所的不同届同学互相交流,彼此学习,加深对生物软件功能的了解,对生物软件的操作有一个基本的认识,还为同学们营造了良好的学习氛围,鼓励同学们积极学习了解生物软件及相关技术知识,使广大同学更加热爱本专业,引导他们自我发现问题,研究问题,解决问题,学思结合、汲取知识,对同学们提高专业技能水平有重要作用。