“猪禽消化道感染与粘膜免疫”创新团队举行“生物信息学分析技术”研讨会

　　差异表达基因分析是当代生物学研究中如探讨疾病发生发展机理、病原体致病因子、病原体与宿主相互作用、宿主抗感染免疫激发机理等内容中最常用的技术之一，基因表达谱数据差异共表达数据分析技术是进行相关研究的基本技能，为帮助团对科技人员和全体在读研究生及所内需要该技术的研究人员深入理解和掌握差异表达基因共表达的数据分析技术，团队首席蔡建平研究员邀请上海市生物信息学中、苏州众信生物技术有限公司（上海）研发部技术主管刘保红博士于2014年8月1日上午进行“基因表达谱数据差异共表达分析技术”的专题讨论。刘博士详细介绍了差异共表达基因数据分析的数学模型建立、数据分析的R语言软件包DCGL（DCGL: an R package for identifying differentially coexpressed genes and links from gene expression microarray data." Bioinformatics26(20): 2637-8）的原理、及其II型糖尿病患者差异共表达基因上的应用，并就该软件包在动物宿主抗感染免疫反应过程中差异基因共表达的应用前景进行了讨论。

　　刘保红博士2006年入同济大学生物信息学系，师从李亦学教授从事基因表达谱分析的算法语言研究，编写完成了以BioConductor平台为基础的基因表达谱分析软件包，2011年毕业获得博士学位后在上海市生物信息学中心和苏州众信生物信息学公司从事基因组学和生物信息学技术研发和社会服务与科研合作等工作，参与完成了骆驼基因组研究（Nature Communication, 2013）等基因组测序和生物信息学分析。有较丰富的基因组组装与注释、生物分子相互作用网络分析、R语言为基础的编程等理论基础和实战经验。

　　猪禽消化道感染与粘膜免疫创新团队

　　2014年8月6日